Взаємозв’язок між конформерами 2'-дезоксирибонуклеотидів у вільному та кристалічному станах

Abstract

Досліджено взаємозв’язок конформацій ізольованих канонічних 2'-дезоксирибонуклеотидів (ДРН) – структурних ланок ДНК, із конформаціями, яких ці молекули набувають у кристалах. Виявлено, що серед конформерів ізольованих ДРН наявні структури, близькі до тих, що реалізуються у кристалічному стані. Показано, що їхні відносні енергії Гіббса лежать у межах (4,7÷14,3) ккал/моль, що значно більше за kBT за нормальних умов. Таким чином, квантово-механічний конформаційний аналіз дозволяє виявити усі можливі конформації ДРН, включаючи ті, що реалізуються у кристалічному стані, енергетично найвигідніші та біологічно компетентні, які реалізуються у складі ДНК.