Quantifying uncertainty of a mathematical model of drug transport in tumors

dc.citation.epage578
dc.citation.issue3
dc.citation.journalTitleМатематичне моделювання та комп'ютинг
dc.citation.spage567
dc.contributor.affiliationУніверситет Ібн Зор
dc.contributor.affiliationУніверситет Каді Айяд
dc.contributor.affiliationIbn Zohr University
dc.contributor.affiliationCadi Ayyad University
dc.contributor.authorЕссаррут, С.
dc.contributor.authorМахані, З.
dc.contributor.authorРагай, С.
dc.contributor.authorEssarrout, S.
dc.contributor.authorMahani, Z.
dc.contributor.authorRaghay, S.
dc.coverage.placenameЛьвів
dc.coverage.placenameLviv
dc.date.accessioned2025-03-04T11:33:06Z
dc.date.created2022-02-28
dc.date.issued2022-02-28
dc.description.abstractУ цій роботі представлено чисельне моделювання в двовимірному режимі для системи диференціальних у частинних похідних, що регулює транспортування ліків у пухлинах із випадковими коефіцієнтами, що описується як випадкове поле. Неперервне стохастичне поле апроксимується скінченною кількістю випадкових величин за допомогою розкладання Кархунена–Лоева і перетворює стохастичну задачу в детерміновану з параметром великої вимірності. Після цього застосовуємо скінченну різницеву схему та інтегратор Ейлера–Маруями в часі. Метод Монте-Карло використовується для обчислення відповідних простих середніх. Обчислюємо оцінку похибки, використовуючи центральну граничну теорему та оцінку похибки для методу скінченних різниць. Деякі числові результати симулюються для ілюстрації теоретичного аналізу. Також пропонуємо порівняння між стохастичним і детермінованим процесами розв’язування нашої системи, де показуємо ефективність прийнятого нами методу.
dc.description.abstractThis paper presents a numerical simulation in the two-dimensional for a system of PDE governing drug transport in tumors with random coefficients, which is described as a random field. The continuous stochastic field is approximated by a finite number of random variables via the Karhunen–Loève expansion and transform the stochastic problem into a determinate one with a parameter in high dimension. Then we apply a finite difference scheme and the Euler–Maruyama Integrator in time. The Monte Carlo method is used to compute corresponding simple averages. We compute the error estimate using the Central Limits Theorem (CLT) and the error estimate for the finite difference method. Some numerical results are simulated to illustrate the theoretical analysis. We also propose a comparison between the stochastic and determinate solving processes of our system where we show the efficiency of our adopted method.
dc.format.extent567-578
dc.format.pages12
dc.identifier.citationEssarrout S. Quantifying uncertainty of a mathematical model of drug transport in tumors / S. Essarrout, Z. Mahani, S. Raghay // Mathematical Modeling and Computing. — Lviv : Lviv Politechnic Publishing House, 2022. — Vol 9. — No 3. — P. 567–578.
dc.identifier.citationenEssarrout S. Quantifying uncertainty of a mathematical model of drug transport in tumors / S. Essarrout, Z. Mahani, S. Raghay // Mathematical Modeling and Computing. — Lviv : Lviv Politechnic Publishing House, 2022. — Vol 9. — No 3. — P. 567–578.
dc.identifier.doidoi.org/10.23939/mmc2022.03.567
dc.identifier.urihttps://ena.lpnu.ua/handle/ntb/63481
dc.language.isoen
dc.publisherВидавництво Львівської політехніки
dc.publisherLviv Politechnic Publishing House
dc.relation.ispartofМатематичне моделювання та комп'ютинг, 3 (9), 2022
dc.relation.ispartofMathematical Modeling and Computing, 3 (9), 2022
dc.relation.references[1] Deb M. K., Babuˇska I. M., Oden J. T. Solution of stochastic partial differential equations using Galerkin finite element techniques. Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering. 190 (48), 6359–6372 (2001).
dc.relation.references[2] Gunzburger M. D., Webster C. G., Zhang G. Stochastic finite element methods for partial differential equations with random input data. Acta Numerica. 23, 521–650 (2014).
dc.relation.references[3] Babuska I., Tempone R., Zouraris G. Galerkin fiite element approximations of stochastic elliptic differential equations. SIAM Journal on Numerical Analysis. 42 (2), 800–825 (2004).
dc.relation.references[4] Barth A., Shwab C., Zollinger N. Multi-level Monte Carlo finite element method for elliptic PDEs with stochastic coefficients. Numerische Mathematik. 119, 123–161 (2011).
dc.relation.references[5] Cliffe K. A., Giles M. B., Scheicl R., Teckentrup A. L. Multilevel Monte Carlo methods and applications to elliptic PDEs with random coefficients. Computing and Visualization in Science. 14, 3 (2011).
dc.relation.references[6] Barth A., Lang A. Multilevel Monte Carlo method with applications to stochastic partial differential equations. International Journal of Computer Mathematics. 89 (18), 2479–2498 (2012).
dc.relation.references[7] Xiu D., Hesthaven J. S. High-order collocation methods for differential equations with random inputs. SIAM Journal on Scientific Computing. 27 (3), 1118–1139 (2005).
dc.relation.references[8] Babuˇska I. M., Nobile F., Tempone R. A stochastic collocation method for elliptic partial differential equations with random input data. SIAM Journal on Numerical Analysis. 45 (3), 1005–1034 (2007).
dc.relation.references[9] Nobile F., Tempone R., Webster C. G. A sparse grid stochastic collocation method for partial differential equations with random input data. SIAM Journal on Numerical Analysis. 46 (5), 2309–2345.
dc.relation.references[10] Sandeep S., Sinek J. P., Frieboes H. B., Ferrari M., Fruehauf J. P., Cristini V. Mathematical modeling of cancer progression and response to chemotherapy. Expert Review of Anticancer Therapy. 6 (10), 1361–1376 (2006).
dc.relation.references[11] Sinek J. P., Sanga S., Zheng X., Frieboes H. B., Ferrari M., Cristini V. Predicting drug pharmacokinetics and effect in vascularized tumors using computer simulation. Journal of Mathematical Biology. 58, 485 (2008).
dc.relation.references[12] El-Kareh A. W., Secomb T. W. A Mathematical model for Cisplatin Cellular Pharmacodynamics. Neoplasia. 5 (2), 161–169 (2003).
dc.relation.references[13] Ghanem R., Spanos P. D. Stochastic Finite Elements: A Spectral Approach. Dover Publications (2003).
dc.relation.references[14] Xiu D. Numerical Methods for Stochastic Computations: A Spectral Method Approach. Princeton University Press, Princeton, NJ, USA (2010).
dc.relation.references[15] Troger V., Fischel J. L., Formento P., Gioanni J., Milano G. Effects of prolonged exposure to cisplatin on cytotoxicity and intracellular drug concentration. European Journal of Cancer. 28 (l), 82–86 (1992).
dc.relation.references[16] Levasseur L. M., Slocum H. K., Rustum Y. M., Greco W. R. Modeling of the time-dependency of in vitro drug cytotoxicity and resistance. Cancer Research. 58 (24), 5749–5761 (1998).
dc.relation.referencesen[1] Deb M. K., Babuˇska I. M., Oden J. T. Solution of stochastic partial differential equations using Galerkin finite element techniques. Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering. 190 (48), 6359–6372 (2001).
dc.relation.referencesen[2] Gunzburger M. D., Webster C. G., Zhang G. Stochastic finite element methods for partial differential equations with random input data. Acta Numerica. 23, 521–650 (2014).
dc.relation.referencesen[3] Babuska I., Tempone R., Zouraris G. Galerkin fiite element approximations of stochastic elliptic differential equations. SIAM Journal on Numerical Analysis. 42 (2), 800–825 (2004).
dc.relation.referencesen[4] Barth A., Shwab C., Zollinger N. Multi-level Monte Carlo finite element method for elliptic PDEs with stochastic coefficients. Numerische Mathematik. 119, 123–161 (2011).
dc.relation.referencesen[5] Cliffe K. A., Giles M. B., Scheicl R., Teckentrup A. L. Multilevel Monte Carlo methods and applications to elliptic PDEs with random coefficients. Computing and Visualization in Science. 14, 3 (2011).
dc.relation.referencesen[6] Barth A., Lang A. Multilevel Monte Carlo method with applications to stochastic partial differential equations. International Journal of Computer Mathematics. 89 (18), 2479–2498 (2012).
dc.relation.referencesen[7] Xiu D., Hesthaven J. S. High-order collocation methods for differential equations with random inputs. SIAM Journal on Scientific Computing. 27 (3), 1118–1139 (2005).
dc.relation.referencesen[8] Babuˇska I. M., Nobile F., Tempone R. A stochastic collocation method for elliptic partial differential equations with random input data. SIAM Journal on Numerical Analysis. 45 (3), 1005–1034 (2007).
dc.relation.referencesen[9] Nobile F., Tempone R., Webster C. G. A sparse grid stochastic collocation method for partial differential equations with random input data. SIAM Journal on Numerical Analysis. 46 (5), 2309–2345.
dc.relation.referencesen[10] Sandeep S., Sinek J. P., Frieboes H. B., Ferrari M., Fruehauf J. P., Cristini V. Mathematical modeling of cancer progression and response to chemotherapy. Expert Review of Anticancer Therapy. 6 (10), 1361–1376 (2006).
dc.relation.referencesen[11] Sinek J. P., Sanga S., Zheng X., Frieboes H. B., Ferrari M., Cristini V. Predicting drug pharmacokinetics and effect in vascularized tumors using computer simulation. Journal of Mathematical Biology. 58, 485 (2008).
dc.relation.referencesen[12] El-Kareh A. W., Secomb T. W. A Mathematical model for Cisplatin Cellular Pharmacodynamics. Neoplasia. 5 (2), 161–169 (2003).
dc.relation.referencesen[13] Ghanem R., Spanos P. D. Stochastic Finite Elements: A Spectral Approach. Dover Publications (2003).
dc.relation.referencesen[14] Xiu D. Numerical Methods for Stochastic Computations: A Spectral Method Approach. Princeton University Press, Princeton, NJ, USA (2010).
dc.relation.referencesen[15] Troger V., Fischel J. L., Formento P., Gioanni J., Milano G. Effects of prolonged exposure to cisplatin on cytotoxicity and intracellular drug concentration. European Journal of Cancer. 28 (l), 82–86 (1992).
dc.relation.referencesen[16] Levasseur L. M., Slocum H. K., Rustum Y. M., Greco W. R. Modeling of the time-dependency of in vitro drug cytotoxicity and resistance. Cancer Research. 58 (24), 5749–5761 (1998).
dc.rights.holder© Національний університет “Львівська політехніка”, 2022
dc.subjectматематичні моделі транспорту ліків у пухлинах
dc.subjectметод Монте–Карло
dc.subjectметод скінченних різниць
dc.subjectкількісна оцінка невизначеності
dc.subjectmathematical models of drug transport in tumors
dc.subjectMonte Carlo method
dc.subjectfinite difference method
dc.subjectuncertainty quantification
dc.titleQuantifying uncertainty of a mathematical model of drug transport in tumors
dc.title.alternativeКількісна оцінка невизначеності математичної моделі транспортування ліків у пухлинах
dc.typeArticle

Files

Original bundle

Now showing 1 - 2 of 2
Loading...
Thumbnail Image
Name:
2022v9n3_Essarrout_S-Quantifying_uncertainty_567-578.pdf
Size:
2.29 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Loading...
Thumbnail Image
Name:
2022v9n3_Essarrout_S-Quantifying_uncertainty_567-578__COVER.png
Size:
439.79 KB
Format:
Portable Network Graphics

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
license.txt
Size:
1.82 KB
Format:
Plain Text
Description: