Прогнозування in silico біологічної активності перефункціоналізованих похідних аміно-9,10-антрацендіонів

Simple item page
dc.citation.epage215
dc.citation.issue868
dc.citation.journalTitleВісник Національного університету «Львівська політехніка». Серія: Хімія, технологія речовин та їх застосування
dc.citation.spage203
dc.contributor.affiliationНаціональний університет “Львівська політехніка”
dc.contributor.authorСтасевич, М. В.
dc.contributor.authorЗварич, В. І.
dc.contributor.authorЛунін, В. В.
dc.contributor.authorКопак, Н. А.
dc.contributor.authorНовіков, В. П.
dc.contributor.authorStasevych, M. V.
dc.contributor.authorZvarych, V. I.
dc.contributor.authorLunin, V. V.
dc.contributor.authorKopak, N. A.
dc.contributor.authorNovikov, V. P.
dc.coverage.placenameЛьвів
dc.date.accessioned2018-04-13T11:28:15Z
dc.date.available2018-04-13T11:28:15Z
dc.date.created2017-03-28
dc.date.issued2017-03-28
dc.description.abstractЗдійснено комп'ютерний прогноз біологічної активності нових похідних 9,10- антрацендіону – 1,2,3-триазолів, дитіокарбаматів, гідразонів із застосуванням програм PASS Online, Cell Line Cytotoxicity Predictor and Antiviral Compound Prediction. Показано, що для переважної більшості сполук спрогнозована протипухлинна активність, яка у деяких випадках доповнюється антивірусною. Проведена комп’ютерна (in silico) оцінка афінності цього типу систем під час використання молекулярного докінгу, яка була порівняна із відповідними значеннями відомих протипухлинних препаратів мітоксантрона та іматініба. Встановлено, що для досліджених структур найвищий рівень зв’язування (-9.44…-10.92) виявлений до сімейства рецепторних тирозинкіназ PDGF (код білка 1T46). Продемонстровано, що синтезовані нові системи відзначаються значенням скорингової функції Gscore на рівні модельного об’єкта.
dc.description.abstractThe computer prediction of biological activity of the new derivatives of 9,10- anthracenedione – 1,2,3-triazoles, dithiocarbamates, hydrazones usingthe program PASS Online, Cell Line Cytotoxicity Predictor and Antiviral Compound Prediction was carryed out. Anticancer and sometimes antiviral activities have been shown for majority of compounds. The computer (in silico) estimation of affinity of this systems type using molecular docking was carried out. The affinity was compared with the corresponding values of known anticancer agents – mitoxanthrone and imatinib. It is established that the proposed compoundshave highest level of binding (-9.44...-10.92) to the family of receptor tyrosine kinases PDGF (protein code 1T46). It was demonstrated that new synthesized systems have scoring function Gscore on the level of the model object.
dc.format.extent203-215
dc.format.pages13
dc.identifier.citationПрогнозування in silico біологічної активності перефункціоналізованих похідних аміно-9,10-антрацендіонів / М. В. Стасевич, В. І. Зварич, В. В. Лунін, Н. А. Копак, В. П. Новіков // Вісник Національного університету «Львівська політехніка». Серія: Хімія, технологія речовин та їх застосування. — Львів : Видавництво Львівської політехніки, 2017. — № 868. — С. 203–215.
dc.identifier.citationenPrediction in silico biological activity of derivatives of refunctionalized amino-9,10-anthracenediones / M. V. Stasevych, V. I. Zvarych, V. V. Lunin, N. A. Kopak, V. P. Novikov, Visnyk Natsionalnoho universytetu "Lvivska politekhnika". Serie: Khimiia, tekhnolohiia rechovyn ta yikh zastosuvannia. — Lviv : Vydavnytstvo Lvivskoi politekhniky, 2017. — No 868. — P. 203–215.
dc.identifier.urihttps://ena.lpnu.ua/handle/ntb/40642
dc.language.isouk
dc.publisherВидавництво Львівської політехніки
dc.relation.ispartofВісник Національного університету «Львівська політехніка». Серія: Хімія, технологія речовин та їх застосування, 868, 2017
dc.relation.references1. Huang Q., Lu G., Shen H. M., Chung M. C. M., Choon N. O. Anti-cancer properties of anthraquinones from Rhubarb. Med. Res. Rev. 2007. – Vol. 27(5). – P.609–630.
dc.relation.references2. Murdock K. C., Child R. G., Fabio P. F., Angier R. B., Wallace R. E., Durr F. E., Citarella R. V. Antitumor Agents. I. 1,4-Bis [(aminoalkyl) amino]-9, l0-anthracenediones. J. Med. Chem. – 1979. – Vol. 22(9). – P.1024–1030.
dc.relation.references3. Shrestha J. P., Fosso M. Y., Bearss J., Chang C.-W. T. Synthesis and anticancer structure activity relationship investigation of cationic anthraquinone analogs. Eur. J. Med. Chem. – 2014. – Vol. 77. – P. 96–102.
dc.relation.references4. Shrestha J. P., Subedi Y. P., Chen L., Chang C.-W. T. A mode of action study of cationic anthraquinoneanalogs: A new class of highly potent anticancer agents. Med. Chem. Comm. – 2015. – Vol. 6(11). – P. 2012–2022.
dc.relation.references5. Thomson Reuters IntegritySM. Thomson ReutersTM; software available at http://thomsonreuters. com/en/products-services/pharma-life-sciences/pharmaceutical-research/integrity. html
dc.relation.references6. Fox E. J. Mechanism of action of mitoxantrone. Neurology. – 2004. – Vol. 63(12 Suppl 6). – S. 15–18.
dc.relation.references7. Nitiss J. L. Targeting DNA topoisomerase II in cancer chemotherapy. Nat. Rev. Cancer. – 2009. – Vol. 9(5). – P. 338–350.
dc.relation.references8. Wu C.-C., Li Y.-C., Wang Y.-R., Li T.-K., Chan N.-L. On the structural basis and design guidelines for type II topoisomerase-targeting anticancer d rugs. Nucleic Acids Res. – 2013. – Vol. 41(22). – P.10630–10640.
dc.relation.references9. Malik E. M., Muller Ch. E.. Anthraquinones as PharmacologicalTools and Drugs. Med. Res. Rev.– 2016. – Vol. 36(4). – P. 705–748.
dc.relation.references10. Liang Z., Ai J., Ding X., Peng X., Zhang D., Zhang R., Wang Y., Liu F., Zheng M., Jiang H., Liu H., Geng M., Luo C. Anthraquinone derivatives as potent inhibitors of c-Met kinase and the extracellular signaling pathway. ACS Med. Chem. Lett. – 2013. – Vol. 4(4). – P.408–413.
dc.relation.references11. Lagunin A., Stepanchikova A., Filimonov D., Poroikov V. PASS: prediction of activity spectra for biologically active substances. Bioinformatics. – 2000. – Vol. 16, No. 8. – P. 747–748.
dc.relation.references12. Stasevych M., Zvarych V., Lunin V., Vovk M., Novikov V. The new 1,2,3-triazolylantracene-9,10-diones: synthesis and computer bioactivity screening. Chem. & Chem. Tech. – 2017. – Vol. 11(1). – P. 1–9.
dc.relation.references13. Zvarych V., Stasevych M., Lunin V. et al. Synthesis and investigation of antioxidant activity of the dithiocarbamates derivatives of 9,10- anthracenedione. Monatsh. Chem. – 2016. –Vol. 147(12). – P. 2093–2101.
dc.relation.references14. Стасевич М. В., Зварич В. И., Лунин В. В., Вовк М. В., Новиков В. П.. Удобный метод синтеза 1-гидразини- лантрацен-9,10-дионов. Журн. Орг. Хим. – 2017. – Т. 53, Вып. 3. – C.438–440.
dc.relation.references15. Qureshi A., Kaur G., Kumar M. AVCpred: An integrated web server for prediction and design of antiviral compounds. Chem. Biol. Drug. Des. – 2017. – Vol. 89. – P. 74–83.
dc.relation.references16. Konova V., Lagunin A., Pogodin P., Kolotova E., Shtil A., Poroikov V. Virtual Screening of Chemical Compounds Active Against Breast Cancer Cell Lines Based on Cell Cycle Modeling, Prediction of Cytotoxicity and Interaction with Targets. SAR & QSAR Environ. Res. – 2014. – Vol. 26. – P. 595–604.
dc.relation.references17. R. Friesner A., Murphy R. B., Repasky M. P. et. al. Extra Precision Glide: Docking and Scoring Incorporating a Model of Hydrophobic Enclosure for Protein-Ligand Complexes. J. Med. Chem. – 2006. – Vol. 49. – P. 6177–6196.
dc.relation.references18. The Protein Data Bank [Електронний ресурс]. – H. M. Berman, J. Westbrook, Z. Feng et. al. Nucleic Acids Research. – 2000. – Vol. 28. – P. 235–242.
dc.relation.referencesen1. Huang Q., Lu G., Shen H. M., Chung M. C. M., Choon N. O. Anti-cancer properties of anthraquinones from Rhubarb. Med. Res. Rev. 2007, Vol. 27(5), P.609–630.
dc.relation.referencesen2. Murdock K. C., Child R. G., Fabio P. F., Angier R. B., Wallace R. E., Durr F. E., Citarella R. V. Antitumor Agents. I. 1,4-Bis [(aminoalkyl) amino]-9, l0-anthracenediones. J. Med. Chem, 1979, Vol. 22(9), P.1024–1030.
dc.relation.referencesen3. Shrestha J. P., Fosso M. Y., Bearss J., Chang C.-W. T. Synthesis and anticancer structure activity relationship investigation of cationic anthraquinone analogs. Eur. J. Med. Chem, 2014, Vol. 77, P. 96–102.
dc.relation.referencesen4. Shrestha J. P., Subedi Y. P., Chen L., Chang C.-W. T. A mode of action study of cationic anthraquinoneanalogs: A new class of highly potent anticancer agents. Med. Chem. Comm, 2015, Vol. 6(11), P. 2012–2022.
dc.relation.referencesen5. Thomson Reuters IntegritySM. Thomson ReutersTM; software available at http://thomsonreuters. com/en/products-services/pharma-life-sciences/pharmaceutical-research/integrity. html
dc.relation.referencesen6. Fox E. J. Mechanism of action of mitoxantrone. Neurology, 2004, Vol. 63(12 Suppl 6), S. 15–18.
dc.relation.referencesen7. Nitiss J. L. Targeting DNA topoisomerase II in cancer chemotherapy. Nat. Rev. Cancer, 2009, Vol. 9(5), P. 338–350.
dc.relation.referencesen8. Wu C.-C., Li Y.-C., Wang Y.-R., Li T.-K., Chan N.-L. On the structural basis and design guidelines for type II topoisomerase-targeting anticancer d rugs. Nucleic Acids Res, 2013, Vol. 41(22), P.10630–10640.
dc.relation.referencesen9. Malik E. M., Muller Ch. E.. Anthraquinones as PharmacologicalTools and Drugs. Med. Res. Rev, 2016, Vol. 36(4), P. 705–748.
dc.relation.referencesen10. Liang Z., Ai J., Ding X., Peng X., Zhang D., Zhang R., Wang Y., Liu F., Zheng M., Jiang H., Liu H., Geng M., Luo C. Anthraquinone derivatives as potent inhibitors of c-Met kinase and the extracellular signaling pathway. ACS Med. Chem. Lett, 2013, Vol. 4(4), P.408–413.
dc.relation.referencesen11. Lagunin A., Stepanchikova A., Filimonov D., Poroikov V. PASS: prediction of activity spectra for biologically active substances. Bioinformatics, 2000, Vol. 16, No. 8, P. 747–748.
dc.relation.referencesen12. Stasevych M., Zvarych V., Lunin V., Vovk M., Novikov V. The new 1,2,3-triazolylantracene-9,10-diones: synthesis and computer bioactivity screening. Chem. & Chem. Tech, 2017, Vol. 11(1), P. 1–9.
dc.relation.referencesen13. Zvarych V., Stasevych M., Lunin V. et al. Synthesis and investigation of antioxidant activity of the dithiocarbamates derivatives of 9,10- anthracenedione. Monatsh. Chem, 2016. –Vol. 147(12), P. 2093–2101.
dc.relation.referencesen14. Stasevich M. V., Zvarich V. I., Lunin V. V., Vovk M. V., Novikov V. P.. Udobnyi metod sinteza 1-hidrazini- lantratsen-9,10-dionov. Zhurn. Orh. Khim, 2017, V. 53, Iss. 3, P.438–440.
dc.relation.referencesen15. Qureshi A., Kaur G., Kumar M. AVCpred: An integrated web server for prediction and design of antiviral compounds. Chem. Biol. Drug. Des, 2017, Vol. 89, P. 74–83.
dc.relation.referencesen16. Konova V., Lagunin A., Pogodin P., Kolotova E., Shtil A., Poroikov V. Virtual Screening of Chemical Compounds Active Against Breast Cancer Cell Lines Based on Cell Cycle Modeling, Prediction of Cytotoxicity and Interaction with Targets. SAR & QSAR Environ. Res, 2014, Vol. 26, P. 595–604.
dc.relation.referencesen17. R. Friesner A., Murphy R. B., Repasky M. P. et. al. Extra Precision Glide: Docking and Scoring Incorporating a Model of Hydrophobic Enclosure for Protein-Ligand Complexes. J. Med. Chem, 2006, Vol. 49, P. 6177–6196.
dc.relation.referencesen18. The Protein Data Bank [Electronic resource], H. M. Berman, J. Westbrook, Z. Feng et. al. Nucleic Acids Research, 2000, Vol. 28, P. 235–242.
dc.relation.urihttp://thomsonreuters
dc.rights.holder© Національний університет “Львівська політехніка”, 2017
dc.rights.holder© Стасевич М. В., Зварич В. І., Лунін В. В., Копак Н. А., Новіков В. П., 2017
dc.subjectперефункціоналізовані 9
dc.subject10-антрацендіони
dc.subjectin silicoпрогнозування
dc.subjectпротипухлинна активність
dc.subjectантивірусна активність
dc.subjectPASS Online
dc.subjectCell Line Cytotoxicity Predictor
dc.subjectAntiviral Compound Prediction
dc.subjectre-functionalized 9
dc.subject10-anthracenediones
dc.subjectin silico prediction
dc.subjectanticancer activity
dc.subjectantiviral activity
dc.subjectPASS Online
dc.subjectCell Line Cytotoxicity Predictor
dc.subjectAntiviral Compound Prediction
dc.subject.udc547.673.5
dc.titleПрогнозування in silico біологічної активності перефункціоналізованих похідних аміно-9,10-антрацендіонів
dc.title.alternativePrediction in silico biological activity of derivatives of refunctionalized amino-9,10-anthracenediones
dc.typeArticle

Files

Original bundle

Now showing 1 - 2 of 2
Thumbnail Image
Name:
2017n868_Stasevych_M_V-Prediction_in_silico_203-215.pdf
Size:
2.16 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Download
Thumbnail Image
Name:
2017n868_Stasevych_M_V-Prediction_in_silico_203-215__COVER.png
Size:
439.38 KB
Format:
Portable Network Graphics
Download

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
3.11 KB
Format:
Plain Text
Description:
Download

Collections

Хімія, технологія речовин та їх застосування. – 2017. – № 868