Computational molecular docking, voltammetric and spectroscopic DNA interaction studies of 9N-(ferrocenylmethyl)adenine
Date
2019-02-28
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Видавництво Львівської політехніки
Lviv Politechnic Publishing House
Lviv Politechnic Publishing House
Abstract
З використанням методів циклічної
вольтамперометрії та електронної спектроскопії за одна-
кових умов проведені вимірювання вільної енергії 9N-(ферро-
ценілметил)аденину (ФMA) з дволанцюговою ДНК. Отримані
результати підтверджені обчислювальним молекулярним
докінгом. Показано, що док-результати добре узгоджуються з
експериментальними даними і що ліганд ФMA поміщений у
невелику борозенку спіралі ДНК.
The binding free energy of 9N-(ferrocenylmethyl) adenine (FMA) with double-stranded deoxyribonucleic acid (DNA) was measured in solution using cyclic voltammetry and electronic spectroscopy (UV-Vis) techniques under similar conditions. The obtained results were confirmed by computational molecular docking. The docking studies yield good approximation with experimental data and showed that the ligand FMA is placed in the minor groove of DNA.
The binding free energy of 9N-(ferrocenylmethyl) adenine (FMA) with double-stranded deoxyribonucleic acid (DNA) was measured in solution using cyclic voltammetry and electronic spectroscopy (UV-Vis) techniques under similar conditions. The obtained results were confirmed by computational molecular docking. The docking studies yield good approximation with experimental data and showed that the ligand FMA is placed in the minor groove of DNA.
Description
Keywords
ДНК, енергія вільного зв’язування, AutoDock, розмір ділянки зв’язування, коефіцієнт дифузії, DNA, free binding energy, AutoDock, size of binding site, diffusion coefficient
Citation
Lanez E. Computational molecular docking, voltammetric and spectroscopic DNA interaction studies of 9N-(ferrocenylmethyl)adenine / Elhafnaoui Lanez, Lazhar Bechki, Touhami Lanez // Chemistry & Chemical Technology. — Lviv : Lviv Politechnic Publishing House, 2019. — Vol 13. — No 1. — P. 11–17.