Synthesis of rbf-network for prediction of secondary protein structure

Date

2014

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Publisher

Видавництво Львівської політехніки

Abstract

Запропоновано методологію синтезу радіально-базисних мереж для вирішення проблеми білкового середнього передбачення структури за допомогою алгоритму вибору клонів. Щоб вирішити цю проблему було використано метод “один проти всіх”. Обчислювальні експерименти щодо випробуваного зразка показали, що точність прогнозування сягає до 72%, що вказує на високу точність запропонованого способу. In this paper we propose the methodology of team radial-basis networks synthesis for solving the problem of protein secondary structure prediction using clonal selection algorithm. To solve such problem the method of “one against all” have been used. The carried out computational experiments on test sample have shown that the prediction accuracy allows to achieve up to 72%, indicating a high accuracy of the proposed method.

Description

Keywords

алгоритм клонального відбору, радіальна базисна функція, метод “один проти всіх”, прогнозування, вторинна структура білка, clonal selection algorithm, radial basis function, “one against all” method, predicting, the secondary structure of protein

Citation

Lytvynenko V. Synthesis of rbf-network for prediction of secondary protein structure / V. Lytvynenko // Вісник Національного університету "Львівська політехніка". – 2014. – № 800 : Комп’ютерні науки та інформаційні технології. – С. 251–260. – Bibliography: 27 titles.